Material de Apoio às Disciplinas

Bioestatística, Experimentação Agrícola e Ciência de Dados com Aplicação em R

Disciplinas

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Graduação • Agronomia FIT5306

Bioestatística e Experimentação Agrícola

Fundamentos estatísticos aplicados à pesquisa agropecuária: estatística descritiva, análise de frequências, distribuições teóricas de probabilidade, amostragem, princípios da experimentação, delineamentos experimentais (DIC, DBC, Fatorial) e análise de regressão linear.

Estatística Descritiva Probabilidade Amostragem DIC / DBC Fatorial Regressão

Pós-Graduação • RGV RGV410046

Introdução à Linguagem R de Programação

Do básico à manipulação e visualização profissional de dados científicos. Estruturas de objetos no R, boas práticas de código, ecossistema Tidyverse (dplyr, tidyr, readr), junção e transformação de tabelas, resumos agrupados e gráficos de alto nível com ggplot2.

Linguagem R Tidyverse dplyr tidyr ggplot2 Ciência de Dados

Instalação dos Softwares

Para reproduzir os exemplos e executar os scripts das disciplinas, você precisará instalar a linguagem R e o ambiente de desenvolvimento RStudio Desktop (ambos gratuitos e multiplataforma):

Download do R (CRAN) Download do RStudio (Posit)

Pacotes Sugeridos

Para garantir que todos os exemplos rodem sem contratempos, instale e carregue o conjunto de pacotes essenciais abaixo. Caso tenha dúvidas sobre o processo de instalação, consulte este vídeo tutorial.

# Instalação dos pacotes necessários (execute uma única vez)
install.packages(c(
  "tidyverse", # Manipulação, transformação e gráficos
  "metan",     # Estatísticas descritivas e análises biométricas
  "rio",       # Importação e exportação ágil de dados
  "emmeans",   # Comparações múltiplas de médias
  "AgroR",     # Análise de experimentos agronômicos
  "leaflet"    # Mapas interativos
))

# Carregamento dos pacotes para a sessão de trabalho
library(tidyverse)  # manipulação de dados e dataviz
library(metan)      # estatísticas descritivas e ensaios multi-ambientes
library(rio)        # importação/exportação de dados
library(emmeans)    # comparação de médias post-hoc
library(AgroR)      # casualização e ANOVA

Docente Responsável

Prof. Dr. Tiago Olivoto

Professor Adjunto • Departamento de Fitotecnia (FIT/CCA/UFSC)

Engenheiro Agrônomo (UNOESC, 2014), Mestre em Agronomia: Agricultura e Ambiente (UFSM, 2017) e Doutor em Agronomia com ênfase em Melhoramento Genético Vegetal e Experimentação Agrícola (UFSM, 2020). Atua no ensino e pesquisa nas áreas de Experimentação Agrícola, Bioestatística, Modelos Mistos e Fenotipagem Digital por Imagens.

É membro atuante da International Biometric Society (IBS) e foi integrante da comissão de Jovens Pesquisadores da Região Brasileira da Sociedade Internacional de Biometria (RBras). É autor e mantenedor dos seguintes pacotes no ecossistema R:

metan (Multi-Environment Trials) pliman (Plant Image Analysis)

Licença e Democratização do Conhecimento

Licença Creative Commons (CC BY-NC-SA 4.0)

Este conteúdo é compartilhado sob a licença Creative Commons Atribuição-NãoComercial-CompartilhaIgual 4.0 Internacional. Você tem a liberdade de compartilhar e adaptar o material para fins não comerciais, atribuindo os créditos devidos.

Selo Democratizando Conhecimento (DC)

O Selo Democratizando Conhecimento (DC), idealizado pelo Prof. Ben Dêivid, certifica materiais de acesso livre, gratuito e de código aberto voltados ao avanço e popularização das Ciências Agrárias.

Onde Estamos?

Rodovia Admar Gonzaga, 1346 - Itacorubi, Florianópolis - SC, 88034-000 • Centro de Ciências Agrárias (CCA/UFSC)

--- title: "Material de Apoio às Disciplinas" subtitle: "Bioestatística, Experimentação Agrícola e Ciência de Dados com Aplicação em R" page-layout: full --- ```{=html} <div class="hero-banner"> <div class="hero-badges-wrapper"> <span class="hero-badge"><i class="bi bi-mortarboard-fill"></i> UFSC</span> <span class="hero-badge"><i class="bi bi-geo-alt-fill"></i> CCA / Centro de Ciências Agrárias</span> <span class="hero-badge"><i class="bi bi-tree-fill"></i> FIT / Departamento de Fitotecnia</span> </div> <div class="hero-title"> Aulas Práticas & <span class="highlight-text">Ciência de Dados em R</span> </div> <div class="hero-subtitle"> Ambiente de apoio às disciplinas de Bioestatística e Programação em R ministradas pelo Prof. Dr. Tiago Olivoto. Tutoriais completos, dados experimentais reais, scripts reprodutíveis e desafios práticos. </div> <div class="hero-actions"> <a href="#disciplinas" class="btn-modern-primary"><i class="bi bi-collection-play-fill"></i> Conhecer Disciplinas</a> <a href="#softwares" class="btn-modern-secondary"><i class="bi bi-download"></i> Instalação de Softwares</a> <a href="#docente" class="btn-modern-secondary"><i class="bi bi-person-badge"></i> Sobre o Professor</a> </div> </div> ``` # Disciplinas {#disciplinas} Selecione a disciplina abaixo para acessar as aulas, cronogramas, dados e materiais interativos: ```{=html} <div class="course-grid"> <div class="course-card card-bio"> <div class="course-card-top-bar"></div> <div> <div class="course-header"> <span class="course-badge badge-grad"><i class="bi bi-book-half"></i> Graduação • Agronomia</span> <span class="course-code">FIT5306</span> </div> <div class="course-title">Bioestatística e Experimentação Agrícola</div> <div class="course-description"> Fundamentos estatísticos aplicados à pesquisa agropecuária: estatística descritiva, análise de frequências, distribuições teóricas de probabilidade, amostragem, princípios da experimentação, delineamentos experimentais (DIC, DBC, Fatorial) e análise de regressão linear. </div> <div class="course-tags"> <span class="course-tag">Estatística Descritiva</span> <span class="course-tag">Probabilidade</span> <span class="course-tag">Amostragem</span> <span class="course-tag">DIC / DBC</span> <span class="course-tag">Fatorial</span> <span class="course-tag">Regressão</span> </div> </div> <div class="course-footer"> <span style="font-size: 0.88rem; color: var(--text-muted);"><i class="bi bi-clock-history"></i> Semestral</span> <a href="FIT5306/FIT5306_00_ABOUT.html" class="course-action-link">Acessar Disciplina <i class="bi bi-arrow-right"></i></a> </div> </div> <div class="course-card card-rgv"> <div class="course-card-top-bar"></div> <div> <div class="course-header"> <span class="course-badge badge-pos"><i class="bi bi-mortarboard"></i> Pós-Graduação • RGV</span> <span class="course-code">RGV410046</span> </div> <div class="course-title">Introdução à Linguagem R de Programação</div> <div class="course-description"> Do básico à manipulação e visualização profissional de dados científicos. Estruturas de objetos no R, boas práticas de código, ecossistema Tidyverse (dplyr, tidyr, readr), junção e transformação de tabelas, resumos agrupados e gráficos de alto nível com ggplot2. </div> <div class="course-tags"> <span class="course-tag">Linguagem R</span> <span class="course-tag">Tidyverse</span> <span class="course-tag">dplyr</span> <span class="course-tag">tidyr</span> <span class="course-tag">ggplot2</span> <span class="course-tag">Ciência de Dados</span> </div> </div> <div class="course-footer"> <span style="font-size: 0.88rem; color: var(--text-muted);"><i class="bi bi-clock-history"></i> Semestral</span> <a href="RGV410046/RGV410046_00_ABOUT.html" class="course-action-link">Acessar Disciplina <i class="bi bi-arrow-right"></i></a> </div> </div> </div> ``` # Instalação dos Softwares {#softwares} Para reproduzir os exemplos e executar os scripts das disciplinas, você precisará instalar a linguagem **R** e o ambiente de desenvolvimento **RStudio Desktop** (ambos gratuitos e multiplataforma): ```{=html} <div class="video-card"> <div class="video-container"> <iframe src="https://www.youtube.com/embed/e89kyYJgWqc" title="Tutorial de instalação do R e RStudio" frameborder="0" allow="accelerometer; autoplay; clipboard-write; encrypted-media; gyroscope; picture-in-picture; web-share" referrerpolicy="strict-origin-when-cross-origin" allowfullscreen></iframe> </div> </div> ``` ::: {style="display: flex; gap: 1rem; flex-wrap: wrap; margin-top: 1.25rem; margin-bottom: 2rem;"} <a class="btn-modern-download" href="https://cran.r-project.org/bin/windows/base/" target="_blank" rel="noopener"> <i class="bi bi-download" style="color: var(--color-emerald-600); font-size: 1.1rem;"></i> <strong>Download do R (CRAN)</strong> </a> <a class="btn-modern-download" href="https://posit.co/download/rstudio-desktop/" target="_blank" rel="noopener"> <i class="bi bi-laptop" style="color: var(--color-blue-600); font-size: 1.1rem;"></i> <strong>Download do RStudio (Posit)</strong> </a> ::: # Pacotes Sugeridos Para garantir que todos os exemplos rodem sem contratempos, instale e carregue o conjunto de pacotes essenciais abaixo. Caso tenha dúvidas sobre o processo de instalação, consulte [este vídeo tutorial](https://www.youtube.com/watch?v=8B8QDZnDhtY). ```r # Instalação dos pacotes necessários (execute uma única vez) install.packages(c( "tidyverse", # Manipulação, transformação e gráficos "metan", # Estatísticas descritivas e análises biométricas "rio", # Importação e exportação ágil de dados "emmeans", # Comparações múltiplas de médias "AgroR", # Análise de experimentos agronômicos "leaflet" # Mapas interativos )) ``` ```{r} #| eval: false #| code-fold: false # Carregamento dos pacotes para a sessão de trabalho library(tidyverse) # manipulação de dados e dataviz library(metan) # estatísticas descritivas e ensaios multi-ambientes library(rio) # importação/exportação de dados library(emmeans) # comparação de médias post-hoc library(AgroR) # casualização e ANOVA ``` # Docente Responsável {#docente} ```{=html} <div class="prof-container"> <div class="prof-image-col"> <img src="figs/site.png" alt="Prof. Dr. Tiago Olivoto" class="prof-avatar" onerror="this.src='https://github.com/TiagoOlivoto.png'"> <div class="prof-social-icons"> <a href="https://github.com/TiagoOlivoto" target="_blank" rel="noopener" class="prof-social-btn" title="GitHub"><i class="bi bi-github"></i></a> <a href="https://www.researchgate.net/profile/Tiago_Olivoto" target="_blank" rel="noopener" class="prof-social-btn" title="ResearchGate"><i class="fab fa-researchgate"></i></a> <a href="https://twitter.com/tolivoto" target="_blank" rel="noopener" class="prof-social-btn" title="Twitter / X"><i class="bi bi-twitter-x"></i></a> <a href="https://olivoto.com.br/" target="_blank" rel="noopener" class="prof-social-btn" title="Website Pessoal"><i class="bi bi-globe"></i></a> </div> </div> <div class="prof-info-col"> <div class="prof-name">Prof. Dr. Tiago Olivoto</div> <div class="prof-role">Professor Adjunto • Departamento de Fitotecnia (FIT/CCA/UFSC)</div> <div class="prof-bio"> Engenheiro Agrônomo (UNOESC, 2014), Mestre em Agronomia: Agricultura e Ambiente (UFSM, 2017) e Doutor em Agronomia com ênfase em Melhoramento Genético Vegetal e Experimentação Agrícola (UFSM, 2020). Atua no ensino e pesquisa nas áreas de Experimentação Agrícola, Bioestatística, Modelos Mistos e Fenotipagem Digital por Imagens. <br><br> É membro atuante da <em>International Biometric Society</em> (IBS) e foi integrante da comissão de Jovens Pesquisadores da Região Brasileira da Sociedade Internacional de Biometria (RBras). É autor e mantenedor dos seguintes pacotes no ecossistema R: </div> <div class="prof-packages"> <a href="https://tiagoolivoto.github.io/metan/" target="_blank" rel="noopener" class="package-badge"> <i class="bi bi-box-seam"></i> metan (Multi-Environment Trials) </a> <a href="https://tiagoolivoto.github.io/pliman/" target="_blank" rel="noopener" class="package-badge"> <i class="bi bi-camera"></i> pliman (Plant Image Analysis) </a> </div> </div> </div> ``` # Licença e Democratização do Conhecimento ::: {style="display: grid; grid-template-columns: repeat(auto-fit, minmax(300px, 1fr)); gap: 1.5rem; margin-top: 1.5rem;"} ::: {.callout-note} ## Licença Creative Commons (CC BY-NC-SA 4.0) <a rel="license" href="http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/" target="_blank" rel="noopener"><img src="https://raw.githubusercontent.com/TiagoOlivoto/tiagoolivoto/master/static/img/gemsr/license.jpg" alt="Licença Creative Commons" style="border-width:0; margin-bottom: 0.75rem;" width="260" height="70"/></a> Este conteúdo é compartilhado sob a licença **Creative Commons Atribuição-NãoComercial-CompartilhaIgual 4.0 Internacional**. Você tem a liberdade de compartilhar e adaptar o material para fins não comerciais, atribuindo os créditos devidos. ::: ::: {.callout-tip} ## Selo Democratizando Conhecimento (DC) <a rel="license" href="https://bendeivide.github.io/dc/" target="_blank" rel="noopener"><img src="https://github.com/bendeivide/dc/raw/main/SeloDC-preto2.png" alt="Selo Democratizando Conhecimento" style="border-width:0; margin-bottom: 0.75rem; max-width: 220px;" /></a> O [Selo Democratizando Conhecimento](https://bendeivide.github.io/dc/) (DC), idealizado pelo Prof. Ben Dêivid, certifica materiais de acesso livre, gratuito e de código aberto voltados ao avanço e popularização das Ciências Agrárias. ::: ::: # Onde Estamos? ```{r} #| eval: false #| echo: false library(leaflet) leaflet() |> addTiles() |> addMarkers(lng = -48.505555, lat = -27.582222, popup = "UFSC - Centro de Ciências Agrárias (CCA)") ``` ::: {style="text-align: center; margin-top: 2rem; color: var(--text-muted); font-size: 0.85rem;"} <i class="bi bi-geo-alt"></i> Rodovia Admar Gonzaga, 1346 - Itacorubi, Florianópolis - SC, 88034-000 • Centro de Ciências Agrárias (CCA/UFSC) :::